diff --git a/README.md b/README.md index 0bed0b6..5cb9173 100644 --- a/README.md +++ b/README.md @@ -772,6 +772,68 @@ Indian Diabetic Retinopathy Image Dataset (IDRiD) [Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/91860/0) + +# 前列腺 + +## PANDA + +| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | +| - | - | - | - | - | - | - | +| [PANDA](https://www.kaggle.com/c/prostate-cancer-grade-assessment/overview) | 前列腺癌分级 | | 镜检图片 | 10616张镜检 | 分类 | tiff | + + +## MSD前列腺分割 + +| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License | +| - | - | - | - | - | - | - | - | +| [MSD前列腺分割](http://medicaldecathlon.com/) | 前列腺中央腺体及外周区域 | 分割 | 多模态核磁 | 32(训练)+16(测试) | | | [CC-BY-SA 4.0](https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/) | + +![msd-prostate](https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/msd-prostate.png) + +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/23912) + +## QIN-PROSTATE-Repeatability + +| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | +| - | - | - | - | - | - | - | +| [QIN-PROSTATE-Repeatability](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/QIN-PROSTATE-Repeatability) | 前列腺癌　| | MRI | 15 |　　| dcm | + +![QIN-Prostate-Repeatability](https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/QIN-Prostate-Repeatability.png) + +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/63950) + +# 胰腺 + +## MSD胰腺分割 + +| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License | +| - | - | - | - | - | - | - | - | +| [MSD胰腺分割](http://medicaldecathlon.com/) | 胰腺肿瘤 | 分割 | CT | 282(训练)+139(验证) | 0/1 | nii | [CC-BY-SA 4.0](https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/) | + +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/23914) + +## PDMR-833975-119-R + +| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | +| - | - | - | - | - | - | - | +| [PDMR-833975-119-R](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/Imaging+tissue+characterization+of+a+patient+derived+xenograft+model+of+adenocarcinoma+pancreas%3A+PDMR-833975-119-R) |　胰腺癌　| |　MRI | 20 | | dcm | + +![PDMR-833975-119-R](https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/PDMR-833975-119-R.png) + +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/64052) + +# 皮肤 + +## SIIM-ISIC Melanoma Classification + +| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | +| - | - | - | - | - | - | - | +| [SIIM-ISIC Melanoma Classification](https://www.kaggle.com/c/siim-isic-melanoma-classification/data) | 皮肤癌病变类别 | 分类 | 皮肤镜 | 88.3K张图片 | 类别 | dicom | + +目前最大的皮肤镜图像集合，用来在皮肤病变图像中之别黑色素瘤，图片以DICOM格式提供，同时包含图像元数据，有的图像也以JPEG和TFRecord格式提供，TFRecords格式的图像已被调整为统一的1024x1024 + +[//]: # (TODO: 添加这个数据集的下载) + # 细胞 ## Data Science Bowl 18 @@ -860,67 +922,6 @@ Aistudio下载 [2D+Time Datasets](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdet [Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/86496) -# 前列腺 - -## PANDA - -| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | -| - | - | - | - | - | - | - | -| [PANDA](https://www.kaggle.com/c/prostate-cancer-grade-assessment/overview) | 前列腺癌分级 | | 镜检图片 | 10616张镜检 | 分类 | tiff | - - -## MSD前列腺分割 - -| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License | -| - | - | - | - | - | - | - | - | -| [MSD前列腺分割](http://medicaldecathlon.com/) | 前列腺中央腺体及外周区域 | 分割 | 多模态核磁 | 32(训练)+16(测试) | | | [CC-BY-SA 4.0](https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/) | - -![msd-prostate](https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/msd-prostate.png) - -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/23912) - -## QIN-PROSTATE-Repeatability - -| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | -| - | - | - | - | - | - | - | -| [QIN-PROSTATE-Repeatability](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/QIN-PROSTATE-Repeatability) | 前列腺癌　| | MRI | 15 |　　| dcm | - -![QIN-Prostate-Repeatability](https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/QIN-Prostate-Repeatability.png) - -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/63950) - -# 胰腺 - -## MSD胰腺分割 - -| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License | -| - | - | - | - | - | - | - | - | -| [MSD胰腺分割](http://medicaldecathlon.com/) | 胰腺肿瘤 | 分割 | CT | 282(训练)+139(验证) | 0/1 | nii | [CC-BY-SA 4.0](https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/) | - -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/23914) - -## PDMR-833975-119-R - -| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | -| - | - | - | - | - | - | - | -| [PDMR-833975-119-R](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/Imaging+tissue+characterization+of+a+patient+derived+xenograft+model+of+adenocarcinoma+pancreas%3A+PDMR-833975-119-R) |　胰腺癌　| |　MRI | 20 | | dcm | - -![PDMR-833975-119-R](https://raw.githubusercontent.com/linhandev/dataset/main/static/PDMR-833975-119-R.png) - -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/64052) - -# 皮肤 - -## SIIM-ISIC Melanoma Classification - -| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | -| - | - | - | - | - | - | - | -| [SIIM-ISIC Melanoma Classification](https://www.kaggle.com/c/siim-isic-melanoma-classification/data) | 皮肤癌病变类别 | 分类 | 皮肤镜 | 88.3K张图片 | 类别 | dicom | - -目前最大的皮肤镜图像集合，用来在皮肤病变图像中之别黑色素瘤，图片以DICOM格式提供，同时包含图像元数据，有的图像也以JPEG和TFRecord格式提供，TFRecords格式的图像已被调整为统一的1024x1024 - -[//]: # (TODO: 添加这个数据集的下载) - # VQA ## PathVQA @@ -956,8 +957,20 @@ Aistudio下载 [2D+Time Datasets](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdet [//]: # (TODO: [Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/90922) +# 数字病理 -# QQ群 +## CAMELYON +| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License | +| - | - | - | - | - | - | - | - | +| [CAMELYON16，17](https://camelyon17.grand-challenge.org/) | | | 镜检 | | 图片 | BB | [CC0](https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/) | + +![CAMELYON17](https://grand-challenge-public-prod.s3.amazonaws.com/b/80/camelyon17_header.x15.jpeg) + +[//]: # (TODO: Aistudio下载) + + + +# 交流群 如果您对医学影像技术感兴趣，欢迎加入医学影像技术交流群 365213556 ，与更多大佬一起交流，共同进步！ ![257867080](https://user-images.githubusercontent.com/29757093/139142701-aa51ade0-c930-4eec-93b6-1af22deae908.jpg) @@ -1052,6 +1065,8 @@ Aistudio下载 [2D+Time Datasets](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdet [parap1uie-s](https://github.com/parap1uie-s) +[Jianpeng Zhao](https://zjpzhao.github.io/) + # Release Note 2021/5/21
开始添加数据集图片，接受多次外部贡献，对存量数据集进行合规检查，数据集总量达到71