diff --git a/README.md b/README.md index 1203a6d..1dfbcb6 100644 --- a/README.md +++ b/README.md @@ -63,80 +63,81 @@ CHAOS是一个多脏器，多模态分割数据集。 # 肺 ## MSD肺脏分割 + | 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | | ------------------------------------------- | -------- | ---- | ---- | ---- | -------- | --------- | | [MSD肺脏分割](http://medicaldecathlon.com/) | 肺脏 | 分割 | CT | 55 | r | MetaImage | -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/10334 -) +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/10334) -| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | -| --------------------------------------------- | ----------- | ---- | ---- | ---- | -------- | --------- | +| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | +| - | - | - | - | - | - | - | | [LoLa11](https://lola11.grand-challenge.org/) | 左右肺/肺页 | 分割 | CT | | 0/1标签 | Metaimage | 55组扫描的肺页分割，包含左右肺，左上，左下，右上，右中，右下肺页的标注。 -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/30417 -) +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/30417) + +## StructSeg2019 | 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | | -------------------------------------------------- | -------- | ---- | ---- | ---- | -------- | -------- | | [StructSeg2019](structseg2019.grand-challenge.org) | | | | | | | -[Aistudio下载]( -) +[Aistudio下载]() + +## 肺部多病智能诊断 | 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | | ------------------------------------------------------------ | -------- | ---- | ---- | ---- | -------- | -------- | | [肺部多病智能诊断](https://tianchi.aliyun.com/competition/entrance/231724/) | | | CT | | | | -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34323 -) +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34323) + +## Chestxray14 | 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | | ----------------------------------------------------- | -------- | ---- | ---- | ---- | -------- | -------- | | [Chestxray14](https://www.kaggle.com/nih-chest-xrays) | | | | | | | -[Aistudio下载]( -) +[Aistudio下载]() + +## CheXpert | 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | | ------------------------------------------------------------ | -------- | ---- | ---- | ---- | -------- | -------- | | [CheXpert](https://stanfordmlgroup.github.io/competitions/chexpert/) | | | | | | | - 介绍论文： [CheXpert: A Large Chest Radiograph Dataset with Uncertainty Labels and Expert Comparison](https://arxiv.org/abs/1901.07031) +介绍论文： [CheXpert: A Large Chest Radiograph Dataset with Uncertainty Labels and Expert Comparison](https://arxiv.org/abs/1901.07031) -[Aistudio下载]( -) +[Aistudio下载]() | 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | | ------------------------------------------------------------ | -------- | ---- | ---- | ---- | -------- | -------- | | [NIHChest Xray](https://www.kaggle.com/nih-chest-xrays/data) | | | | | | | - 介绍论文： [ChestX-ray8: Hospital-scale Chest X-ray Database and Benchmarks on Weakly-Supervised Classification and Localization of Common Thorax Diseases](http://openaccess.thecvf.com/content_cvpr_2017/papers/Wang_ChestX-ray8_Hospital-Scale_Chest_CVPR_2017_paper.pdf) +介绍论文： [ChestX-ray8: Hospital-scale Chest X-ray Database and Benchmarks on Weakly-Supervised Classification and Localization of Common Thorax Diseases](http://openaccess.thecvf.com/content_cvpr_2017/papers/Wang_ChestX-ray8_Hospital-Scale_Chest_CVPR_2017_paper.pdf) -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/35660 -) +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/35660) | 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | | ------------------------------------------------------------ | -------- | ---- | ---- | ---- | -------- | -------- | | [QIN Lung CT](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/QIN+LUNG+CT) | | | CT | | | | -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/35205 -) +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/35205) | 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | -| ------------------------------------------------------------ | -------- | ---- | ---- | ---- | -------- | -------- | +| - | -------- | ---- | ---- | ---- | -------- | -------- | | [4D-Lung](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/4D-Lung) | | | | | | | -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/37482 -) +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/37482) -| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | -| ------------------------------------------- | -------- | ---- | ---- | ---- | -------- | -------- | -| [MSD肺脏分割](http://medicaldecathlon.com/) | | | | | | | +| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | +| - | - | - | - | - | - | - | +| [NSCLC-Radiomics](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/NSCLC-Radiomics) | 非小细胞癌　| 分割　|　CT | 422 | | dcm | -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/10334 -) +![](./static/NSCLC-Radiomics.png) + +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/64048) ## 肺结核 @@ -145,16 +146,14 @@ CHAOS是一个多脏器，多模态分割数据集。 | [Shenzhen Hospital X-ray Set](https://lhncbc.nlm.nih.gov/publication/pub9931) | 肺结核/正常 | 分类 | CXR | 662 | 类别 | 图片 | 深圳第三医院收集的肺结核胸透数据集，包含326张正常扫描和336张不正常的扫描。 -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/25237 -) +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/25237) | 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | | ------------------------------------------------------------ | ----------- | ---- | ---- | ---- | -------- | -------- | | [Montgomery County X-ray Set](https://lhncbc.nlm.nih.gov/publication/pub9931) | 肺结核/正常 | 分类 | CXR | 138 | 类别 | 图片 | 蒙哥马利市收集的肺结核胸透数据集，包含80张正常的扫描和58张不正常的扫描。 -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34229 -) +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34229) ## 肺炎 ### Ieee8023 @@ -244,17 +243,17 @@ Chest Imaging with Clinical and Genomic Correlates Representing a Rural COVID-19 ### CT Images in COVID-19 | 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | -| ----- | ----- | ---- | ---- | ------------- | -------- | -------- | -| [CT Images in COVID-19](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/CT+Images+in+COVID-19) | | | | | | nii| - +| - | - | - | - | - | - | - | +| [CT Images in COVID-19](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/CT+Images+in+COVID-19) | 无标签 | 分类/分割 | CT | 650 | 无 | nii| +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/63794) ## 肺结节 -| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | -| ---------------------- | -------- | ---- | ---- | ---- | -------- | -------- | -| [LIDC/IDIR](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/LIDC-IDRI) | | | | | | | +| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | +| - | - | - | - | - | - | - | +| [LIDC-IDRI](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/LIDC-IDRI) | 肺部肿瘤 | 目标检测 | CT | 1012 | xls | dcm | - 介绍论文： [The Lung Image Database Consortium (LIDC) and Image Database Resource Initiative (IDRI): A Completed Reference Database of Lung Nodules on CT Scans](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3041807/)[The public cancer radiology imaging collections of The Cancer Imaging Archive](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3041807/) +介绍论文： [The Lung Image Database Consortium (LIDC) and Image Database Resource Initiative (IDRI): A Completed Reference Database of Lung Nodules on CT Scans](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3041807/)[The public cancer radiology imaging collections of The Cancer Imaging Archive](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3041807/) [Aistudio下载]() @@ -292,14 +291,13 @@ Chest Imaging with Clinical and Genomic Correlates Representing a Rural COVID-19 | ------------------------------------------------------------ | -------- | ---- | ---- | ---- | -------- | -------- | | [Data Science Bowl 17](https://www.kaggle.com/c/data-science-bowl-2017) | | | | | | | -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/25423 -) +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/25423) ## 气胸 | 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | | - | - | - | - | - | - | - | -| ["SIIM-ACR Pneumothorax Segmentation]() | | | | | | | +| [SIIM-ACR Pneumothorax Segmentation]() | | | | | | | # 乳腺癌 @@ -309,20 +307,17 @@ Chest Imaging with Clinical and Genomic Correlates Representing a Rural COVID-19 介绍论文： [Deep Learning to Improve Breast Cancer Early Detection on Screening Mammography](https://arxiv.org/abs/1708.09427) [A curated mammography data set for use in computer-aided detection and diagnosis research](https://www.nature.com/articles/sdata2017177) -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/37567 -) +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/37567) | 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | | ------------------------------------------------------------ | -------- | ---- | ---- | ---- | -------- | -------- | | QIN Breast [01](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/QIN-Breast)[02](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/QIN-BREAST-02) | | | MRI | 67 | | | -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/37536 -) +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/37536) | 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | | - | - | - | - | - | - | - | -| [Rider Breast MRI](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/RIDER+Breast+MRI) | | | MRI | " - | | | +| [Rider Breast MRI](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/RIDER+Breast+MRI) | | | MRI | | | | | 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | | ------------------------------------------------------------ | -------- | ---- | ---- | ---- | -------- | -------- | @@ -447,7 +442,7 @@ DRIVE数据集是一个糖尿病病人眼底血管分割数据集。 | ------------------------------------------------ | ------------- | ---- | ------------ | ---- | -------- | -------- | | [ODIR-5k](https://odir2019.grand-challenge.org/) | 正常和7种疾病 | 分类 | 眼底彩色照片 | 5000 | | 图片 | -ODIR-5K包括5 相关项目： 000名患者的年龄，双眼的彩色眼底照片和医生的诊断关键词。该数据集是上工医疗技术有限公司从中国不同医院/医疗中心收集的“真实”患者信息。在这些机构中，眼底图像由市场上的各种相机捕获，例如Canon，Zeiss和Kowa，因此导致各种各样的图像分辨率。病人的识别信息会被移除。注释由经过培训的人类读者进行标记，并具有质量控制管理。患者分为8个标签，包括正常（N），糖尿病（D），青光眼（G），白内障（C），AMD（A），高血压（H），近视（M）和其他疾病/异常（O）。" +ODIR-5K包括5000名患者的年龄，双眼的彩色眼底照片和医生的诊断关键词。该数据集是上工医疗技术有限公司从中国不同医院/医疗中心收集的“真实”患者信息。在这些机构中，眼底图像由市场上的各种相机捕获，例如Canon，Zeiss和Kowa，因此导致各种各样的图像分辨率。病人的识别信息会被移除。注释由经过培训的人类读者进行标记，并具有质量控制管理。患者分为8个标签，包括正常（N），糖尿病（D），青光眼（G），白内障（C），AMD（A），高血压（H），近视（M）和其他疾病/异常（O）。 | 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | | --------------------------------------------------------- | -------- | ---- | ---------- | ---- | -------- | -------- | @@ -526,16 +521,20 @@ FIRE 是一个视网膜眼底图像数据集，包含 129张 眼底视网膜图 | ------------------------------------------------------------ | ------------ | ---- | -------- | ----------- | -------- | -------- | | [PANDA](https://www.kaggle.com/c/prostate-cancer-grade-assessment/overview) | 前列腺癌分级 | | 镜检图片 | 10616张镜检 | 分类 | tiff | -[Aistudio下载]( -) +[Aistudio下载]() -| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | -| --------------------------------------------- | -------- | ---- | ---- | ---- | -------- | -------- | +| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | +| - | - | - | - | - | - | - | | [MSD前列腺分割](http://medicaldecathlon.com/) | | | | | | | -[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/23912 -) +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/23912) +## QIN-PROSTATE-Repeatability +| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | +| - | - | - | - | - | - | - | +| [QIN-PROSTATE-Repeatability](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/QIN-PROSTATE-Repeatability) | 前列腺癌　| | MRI | 15 |　　| dcm | +![](./static/QIN-Prostate-Repeatability.png) +[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/63950) # 胰腺 | 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | diff --git a/download.md b/download.md new file mode 100644 index 0000000..4c3b0a2 --- /dev/null +++ b/download.md @@ -0,0 +1,2 @@ +# 数据集下载技巧 +这个部分记录一些下载数据集的技巧。 diff --git a/static/NSCLC-Radiomics.png b/static/NSCLC-Radiomics.png new file mode 100644 index 0000000..c96ff57 Binary files /dev/null and b/static/NSCLC-Radiomics.png differ diff --git a/static/QIN-Prostate-Repeatability.png b/static/QIN-Prostate-Repeatability.png new file mode 100644 index 0000000..511d992 Binary files /dev/null and b/static/QIN-Prostate-Repeatability.png differ