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https://github.com/linhandev/dataset.git
已同步 2025-12-06 06:36:51 +00:00
修正格式问题
这个提交包含在:
512
README.md
512
README.md
@@ -6,14 +6,14 @@
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- 如果发现项目已有的内容中有任何错误(包括但不限于格式问题,网址失效,数据错误,简介信息补充等),可以通过PR进行修正。
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- 如果您想用的数据集没有出现在列表中,请按照模板[提交Issue](https://github.com/linhandev/dataset/issues/new?assignees=linhandev&labels=%E6%96%B0%E5%A2%9E%E6%95%B0%E6%8D%AE%E9%9B%86&template=-----.md&title=%5B%E6%96%B0%E5%A2%9E%5D+%E6%B7%BB%E5%8A%A0%E6%96%B0%E6%95%B0%E6%8D%AE%E9%9B%86%E3%80%80xx),并尽量详细的描述数据集信息。我们会尽快进行下载和添加。
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[//]: # (TODO: 在github上创建requeset一个数据集的模板)
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当前共收录 20 个方向的 67 个数据集
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当前共收录约 20 个方向的 70+ 个数据集
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# 肝脏
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## LiTS
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[//]: # (FIN)
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [LiTS](https://competitions.codalab.org/competitions/17094) | 肝脏/肝脏肿瘤 | 分割 | CT | 130+70 | 0/1标签 | nii |
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@@ -29,6 +29,7 @@ LiTS数据集包含130组训练数据和70组测试数据,其中70组测试数
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/10273)
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## Sliver07
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[//]: # (FIN)
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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@@ -40,12 +41,13 @@ LiTS数据集包含130组训练数据和70组测试数据,其中70组测试数
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/19906)
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## 3D-IRCADb
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## 3D-IRCADB
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[//]: # (FIN)
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| 3D-IRCADb [01](https://www.ircad.fr/research/3d-ircadb-01/) [02](https://www.ircad.fr/research/3d-ircadb-01/) | 肝脏/肝肿瘤 | 分割 | CT | 20+2 | surface mesh | dcm |
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3D-IRCADb是比较早的一个数据集,有两个子集,分别包含20组和2组CT片子。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/10293)
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@@ -54,16 +56,19 @@ LiTS数据集包含130组训练数据和70组测试数据,其中70组测试数
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [CHAOS](https://chaos.grand-challenge.org/) | 肝/肾/脾 | 分割 | CT+MRI | 40CT+120MRI | 0/1标签 | dcm |
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| [CHAOS](https://chaos.grand-challenge.org/) | 肝/肾/脾 | 分割 | CT+MRI | 40CT+120MRI | 0/1标签 | dcm |
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CHAOS是一个多脏器,多模态分割数据集。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/23864)
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## TCGA-LIHC
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [TCGA-LIHC](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/TCGA-LIHC) | 肝 | | CT | 1688 | 无标签 | |
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| [TCGA-LIHC](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/TCGA-LIHC) | 肝 | | CT/MR/PT | 97患者/237套 | 无标签 | dcm |
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/37439)
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@@ -80,7 +85,7 @@ CHAOS是一个多脏器,多模态分割数据集。
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [MSD肺脏分割](http://medicaldecathlon.com/) | 肺脏 | 分割 | CT | 55 | r | MetaImage |
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| [MSD肺脏分割](http://medicaldecathlon.com/) | 肺脏 | 分割 | CT | 55 | | MetaImage |
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/10334)
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@@ -91,6 +96,7 @@ CHAOS是一个多脏器,多模态分割数据集。
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| [LoLa11](https://lola11.grand-challenge.org/) | 左右肺/肺页 | 分割 | CT | | 0/1标签 | Metaimage |
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55组扫描的肺页分割,包含左右肺,左上,左下,右上,右中,右下肺页的标注。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/30417)
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## StructSeg2019
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@@ -122,8 +128,8 @@ CHAOS是一个多脏器,多模态分割数据集。
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## NIHChest Xray
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [NIHChest Xray](https://www.kaggle.com/nih-chest-xrays/data) | | | | | | | CC0: Public Domain |
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| - | - | - | - | - | - | - | - |
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| [NIHChest Xray](https://www.kaggle.com/nih-chest-xrays/data) | | | | | | CC0: Public Domain | | |
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介绍论文: [ChestX-ray8: Hospital-scale Chest X-ray Database and Benchmarks on Weakly-Supervised Classification and Localization of Common Thorax Diseases](http://openaccess.thecvf.com/content_cvpr_2017/papers/Wang_ChestX-ray8_Hospital-Scale_Chest_CVPR_2017_paper.pdf)
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@@ -190,7 +196,8 @@ CHAOS是一个多脏器,多模态分割数据集。
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [covid19-ct-scans](https://www.kaggle.com/andrewmvd/covid19-ct-scans) | 左右肺/新冠感染 | 分割 | CT | 20 | | nii |
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数据来自Ieee8023,对20组扫描进行了左右肺和感染区的标注。基于这个数据集和另外几个数据集,大佬们做了一个新冠分割的[benchmark](https://gitee.com/junma11/COVID-19-CT-Seg-Benchmark)
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||||
数据来自Ieee8023,对20组扫描进行了左右肺和感染区的标注。基于这个数据集和另外几个数据集,大佬们做了一个新冠分割的 [benchmark](https://gitee.com/junma11/COVID-19-CT-Seg-Benchmark)
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34221)
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### COVID-CT
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@@ -200,6 +207,7 @@ CHAOS是一个多脏器,多模态分割数据集。
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| [COVID-CT](https://github.com/UCSD-AI4H/COVID-CT) | | 分类 | CT | 349 | | 图片 |
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包含216名新冠患者的349张胸部CT图片,从相关paper中收集。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/27732)
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### Figure1-COVID-chestxray-dataset
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@@ -209,6 +217,7 @@ CHAOS是一个多脏器,多模态分割数据集。
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| [Figure1-COVID-chestxray-dataset](https://github.com/agchung/Figure1-COVID-chestxray-dataset) | | 分类 | CXR | 48 | | 图片 |
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DarwinAI收集的一些新冠CT的图片,是CovidX数据集的一部分。持续更新,使用前可以先pull。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34208)
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### RSNA肺炎检测
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@@ -218,6 +227,7 @@ DarwinAI收集的一些新冠CT的图片,是CovidX数据集的一部分。持
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| [RSNA肺炎检测](https://www.kaggle.com/c/rsna-pneumonia-detection-challenge/) | 之否肺炎/肺炎区域BB | 分类/检测 | CXR | 26684+3000 | | 图片 |
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RSNA是北美放射学会在Kaggle上组织的一个比赛数据集,数据来自[NIH](https://nihcc.app.box.com/v/ChestXray-NIHCC)。包含26684张训练数据,有图片的分类和肺炎区域的边界框。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34214)
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### CovidX
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@@ -227,7 +237,7 @@ RSNA是北美放射学会在Kaggle上组织的一个比赛数据集,数据来
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| [CovidX](https://github.com/lindawangg/COVID-Net/blob/master/docs/COVIDx.md) | 新冠/其他肺炎/正常 | 分类 | CT | 13569+231 | | 图片 |
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CovidX数据集是DarwinAI训练[CovidNet](https://github.com/lindawangg/COVID-Net)做的一个数据集,本身没有新的数据,是Ieee8023,Figure1和RSNA组合成的一个数据集。
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[Aistudio下载]()
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### Flyai Covid
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@@ -236,6 +246,7 @@ CovidX数据集是DarwinAI训练[CovidNet](https://github.com/lindawangg/COVID-N
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| [Flyai Covid](https://www.flyai.com/d/ChestXray02) | | | | | | |
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Flyai举办的一个新冠分类比赛。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34230)
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### covid19-radiography-database
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@@ -245,6 +256,7 @@ Flyai举办的一个新冠分类比赛。
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| [covid19-radiography-database](https://www.kaggle.com/tawsifurrahman/covid19-radiography-database) | 新冠/其他肺炎/正常 | 分类 | CT | 219+1314+1345 | | 图片 |
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跟CovidX一样是一个组合数据集,数据来自论文图片和RSNA。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34241)
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### COVID-19-AR
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@@ -254,6 +266,7 @@ Flyai举办的一个新冠分类比赛。
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| [COVID-19-AR](https://wiki.cancerimagingarchive.net/pages/viewpage.action?pageId=70226443) | | | | | | dcm|
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Chest Imaging with Clinical and Genomic Correlates Representing a Rural COVID-19 Positive Population (COVID-19-AR)
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/63553)
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@@ -262,6 +275,7 @@ Chest Imaging with Clinical and Genomic Correlates Representing a Rural COVID-19
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [CT Images in COVID-19](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/CT+Images+in+COVID-19) | 无标签 | 分类/分割 | CT | 650 | 无 | nii|
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/63794)
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## 肺结节
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@@ -272,7 +286,9 @@ Chest Imaging with Clinical and Genomic Correlates Representing a Rural COVID-19
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [LIDC-IDRI](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/LIDC-IDRI) | 肺部肿瘤 | 目标检测 | CT | 1012 | xls | dcm |
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介绍论文: [The Lung Image Database Consortium (LIDC) and Image Database Resource Initiative (IDRI): A Completed Reference Database of Lung Nodules on CT Scans](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3041807/)[The public cancer radiology imaging collections of The Cancer Imaging Archive](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3041807/)
|
||||
介绍论文: [The Lung Image Database Consortium (LIDC) and Image Database Resource Initiative (IDRI): A Completed Reference Database of Lung Nodules on CT Scans](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3041807/)
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||||
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||||
[The public cancer radiology imaging collections of The Cancer Imaging Archive](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3041807/)
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Aistudio下载 [Part1](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/63957) [Part2](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/64008)
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||||
@@ -420,8 +436,431 @@ Aistudio下载 [Part1](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/63957)
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [Kits19](https://kits19.grand-challenge.org/) | 肾肿瘤 | 分割 | CT | 300 | 0/1 | nii |
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||||
| [Kits19](https://kits19.grand-challenge.org/) | 肾肿瘤 | 分割
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当前共收录 20 个方向的 67 个数据集
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# 肝脏
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## LiTS
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [LiTS](https://competitions.codalab.org/competitions/17094) | 肝脏/肝脏肿瘤 | 分割 | CT | 130+70 | 0/1标签 | nii |
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LiTS数据集包含130组训练数据和70组测试数据,其中70组测试数据是没有标签的。LiTS训练集中包含3DIRCADB中的所有数据,所以如果合并多个数据集不要合并这两个。
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||||
分割结果可以在线提交进行评估,[在线提交方法参考](https://github.com/PatrickChrist/LITS-CHALLENGE)。 [在线提交地址](https://competitions.codalab.org/competitions/17094)
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数据集论文:[The Liver Tumor Segmentation Benchmark (LiTS)](https://arxiv.org/abs/1901.04056)
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相关项目: [基于Paddle的肝脏CT影像分割](https://aistudio.baidu.com/aistudio/projectdetail/250994)
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/10273)
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## Sliver07
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [Sliver07](https://sliver07.grand-challenge.org/) | 肝脏 | 分割 | CT | 20+10 | 0/1标签 | MetaImage |
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这个数据集比较老了,现在用的也比较少,一些研究会将sliver和lits合起来,这样基本上就是所有常用的关于肝脏分割的公开数据了。mhd格式可以用 SimpleITK 读,在medseg项目中有[转换成nii的脚本](https://github.com/linhandev/medSeg/blob/master/tool/train/mhd2nii.py)
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||||
[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/19906)
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## 3D-IRCADb
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| 3D-IRCADb [01](https://www.ircad.fr/research/3d-ircadb-01/) [02](https://www.ircad.fr/research/3d-ircadb-01/) | 肝脏/肝肿瘤 | 分割 | CT | 20+2 | surface mesh | dcm |
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||||
3D-IRCADb是比较早的一个数据集,有两个子集,分别包含20组和2组CT片子。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/10293)
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## CHAOS
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [CHAOS](https://chaos.grand-challenge.org/) | 肝/肾/脾 | 分割 | CT+MRI | 40CT+120MRI | 0/1标签 | dcm |
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CHAOS是一个多脏器,多模态分割数据集。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/23864)
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## TCGA-LIHC
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [TCGA-LIHC](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/TCGA-LIHC) | 肝 | | CT | 1688 | 无标签 | |
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/37439)
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## MSD肝脏血管分割
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [MSD肝脏血管分割](http://medicaldecathlon.com/) | | | | | | |
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/10333)
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# 肺
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## MSD肺脏分割
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [MSD肺脏分割](http://medicaldecathlon.com/) | 肺脏 | 分割 | CT | 55 | r | MetaImage |
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/10334)
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## LoLa11肺页分割
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [LoLa11](https://lola11.grand-challenge.org/) | 左右肺/肺页 | 分割 | CT | | 0/1标签 | Metaimage |
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55组扫描的肺页分割,包含左右肺,左上,左下,右上,右中,右下肺页的标注。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/30417)
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## StructSeg2019
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [StructSeg2019](structseg2019.grand-challenge.org) | | | | | | |
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## 肺部多病智能诊断
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [肺部多病智能诊断](https://tianchi.aliyun.com/competition/entrance/231724/) | | | CT | | | |
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34323)
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## CheXpert
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [CheXpert](https://stanfordmlgroup.github.io/competitions/chexpert/) | | | | | | |
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介绍论文: [CheXpert: A Large Chest Radiograph Dataset with Uncertainty Labels and Expert Comparison](https://arxiv.org/abs/1901.07031)
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## NIHChest Xray
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 | License |
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| - | - | - | - | - | - | - | - |
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| [NIHChest Xray](https://www.kaggle.com/nih-chest-xrays/data) | | | | | | CC0: Public Domain |
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介绍论文: [ChestX-ray8: Hospital-scale Chest X-ray Database and Benchmarks on Weakly-Supervised Classification and Localization of Common Thorax Diseases](http://openaccess.thecvf.com/content_cvpr_2017/papers/Wang_ChestX-ray8_Hospital-Scale_Chest_CVPR_2017_paper.pdf)
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/35660)
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## QIN Lung CT
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [QIN Lung CT](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/QIN+LUNG+CT) | | | CT | | | |
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/35205)
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## 4D-Lung
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [4D-Lung](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/4D-Lung) | | | | | | |
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/37482)
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## NSCLC-Radiomics
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [NSCLC-Radiomics](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/NSCLC-Radiomics) | 非小细胞癌 | 分割 | CT | 422 | | dcm |
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/63958)
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## 肺结核
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### Shenzhen Hospital X-ray Set
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [Shenzhen Hospital X-ray Set](https://lhncbc.nlm.nih.gov/publication/pub9931) | 肺结核/正常 | 分类 | CXR | 662 | 类别 | 图片 |
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深圳第三医院收集的肺结核胸透数据集,包含326张正常扫描和336张不正常的扫描。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/25237)
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### Montgomery County X-ray Set
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [Montgomery County X-ray Set](https://lhncbc.nlm.nih.gov/publication/pub9931) | 肺结核/正常 | 分类 | CXR | 138 | 类别 | 图片 |
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蒙哥马利市收集的肺结核胸透数据集,包含80张正常的扫描和58张不正常的扫描。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34229)
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## 肺炎
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### Ieee8023
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [Ieee8023](https://github.com/ieee8023/covid-chestxray-dataset) | 肺脏 | 分类 | CT | 20 | | nii |
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持续搜集公开的新冠CT扫描,目前有20个病例。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34221)
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### covid19-ct-scans
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [covid19-ct-scans](https://www.kaggle.com/andrewmvd/covid19-ct-scans) | 左右肺/新冠感染 | 分割 | CT | 20 | | nii |
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数据来自Ieee8023,对20组扫描进行了左右肺和感染区的标注。基于这个数据集和另外几个数据集,大佬们做了一个新冠分割的[benchmark](https://gitee.com/junma11/COVID-19-CT-Seg-Benchmark)
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34221)
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### COVID-CT
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [COVID-CT](https://github.com/UCSD-AI4H/COVID-CT) | | 分类 | CT | 349 | | 图片 |
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包含216名新冠患者的349张胸部CT图片,从相关paper中收集。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/27732)
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### Figure1-COVID-chestxray-dataset
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [Figure1-COVID-chestxray-dataset](https://github.com/agchung/Figure1-COVID-chestxray-dataset) | | 分类 | CXR | 48 | | 图片 |
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DarwinAI收集的一些新冠CT的图片,是CovidX数据集的一部分。持续更新,使用前可以先pull。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34208)
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### RSNA肺炎检测
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [RSNA肺炎检测](https://www.kaggle.com/c/rsna-pneumonia-detection-challenge/) | 之否肺炎/肺炎区域BB | 分类/检测 | CXR | 26684+3000 | | 图片 |
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RSNA是北美放射学会在Kaggle上组织的一个比赛数据集,数据来自[NIH](https://nihcc.app.box.com/v/ChestXray-NIHCC)。包含26684张训练数据,有图片的分类和肺炎区域的边界框。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34214)
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### CovidX
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [CovidX](https://github.com/lindawangg/COVID-Net/blob/master/docs/COVIDx.md) | 新冠/其他肺炎/正常 | 分类 | CT | 13569+231 | | 图片 |
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CovidX数据集是DarwinAI训练[CovidNet](https://github.com/lindawangg/COVID-Net)做的一个数据集,本身没有新的数据,是Ieee8023,Figure1和RSNA组合成的一个数据集。
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### Flyai Covid
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [Flyai Covid](https://www.flyai.com/d/ChestXray02) | | | | | | |
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Flyai举办的一个新冠分类比赛。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34230)
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### covid19-radiography-database
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [covid19-radiography-database](https://www.kaggle.com/tawsifurrahman/covid19-radiography-database) | 新冠/其他肺炎/正常 | 分类 | CT | 219+1314+1345 | | 图片 |
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跟CovidX一样是一个组合数据集,数据来自论文图片和RSNA。
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/34241)
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### COVID-19-AR
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [COVID-19-AR](https://wiki.cancerimagingarchive.net/pages/viewpage.action?pageId=70226443) | | | | | | dcm|
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Chest Imaging with Clinical and Genomic Correlates Representing a Rural COVID-19 Positive Population (COVID-19-AR)
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/63553)
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### CT Images in COVID-19
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [CT Images in COVID-19](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/CT+Images+in+COVID-19) | 无标签 | 分类/分割 | CT | 650 | 无 | nii|
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/63794)
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## 肺结节
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### LIDC-IDRI
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [LIDC-IDRI](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/LIDC-IDRI) | 肺部肿瘤 | 目标检测 | CT | 1012 | xls | dcm |
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介绍论文: [The Lung Image Database Consortium (LIDC) and Image Database Resource Initiative (IDRI): A Completed Reference Database of Lung Nodules on CT Scans](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3041807/)
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[The public cancer radiology imaging collections of The Cancer Imaging Archive](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3041807/)
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Aistudio下载 [Part1](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/63957) [Part2](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/64008)
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### LUNA16
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [LUNA16](https://luna16.grand-challenge.org) | | | | | | |
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/1860)
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### 天池肺部结节
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [天池肺部结节](https://tianchi.aliyun.com/competition/entrance/231601/introduction) | | | | | | |
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[训练集](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetDetail/20000) [测试集](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/10063)
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### LNDB
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [LNDB](https://lndb.grand-challenge.org) | 直径大于3mm的肿瘤分割标注/小于3mm肿瘤和非肿瘤标记中心 | 分割/分类 | CT | 294 | XML | MetaImage |
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介绍论文: [LNDb: A Lung Nodule Database on Computed Tomography](https://arxiv.org/abs/1911.08434)
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/23909)
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### Lung Nodule Malignancy
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [Lung Nodule Malignancy](https://www.kaggle.com/kmader/lungnodemalignancy) | 肺结界良恶性 | 分类 | CT | 4165+2526 | | tif |
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||||
[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/28474)
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### Data Science Bowl 17
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [Data Science Bowl 17](https://www.kaggle.com/c/data-science-bowl-2017) | | | | | | |
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/25423)
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### Lung-PET-CT-Dx
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [Lung-PET-CT-Dx](https://wiki.cancerimagingarchive.net/pages/viewpage.action?pageId=70224216) | 肺癌 | 目标检测 | CT | 363 | xml | dcm |
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## 气胸
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### SIIM-ACR Pneumothorax Segmentation
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [SIIM-ACR Pneumothorax Segmentation]() | | | | | | |
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# 乳腺癌
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## CBIS-DDSM
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [CBIS-DDSM](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/CBIS-DDSM) | 正常/良性/恶性 | 分类 | CT | 2620 | | |
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介绍论文: [Deep Learning to Improve Breast Cancer Early Detection on Screening Mammography](https://arxiv.org/abs/1708.09427) [A curated mammography data set for use in computer-aided detection and diagnosis research](https://www.nature.com/articles/sdata2017177)
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||||
[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/37567)
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## QIN Breast
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| QIN Breast [01](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/QIN-Breast)[02](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/QIN-BREAST-02) | | | MRI | 67 | | |
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||||
[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/37536)
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## Rider Breast MRI
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [Rider Breast MRI](https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/Public/RIDER+Breast+MRI) | | | MRI | | | |
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## ACRIN 6688
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [ACRIN 6688](https://wiki.cancerimagingarchive.net/pages/viewpage.action?pageId=30671268) | | | CT | 83 | | |
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/37565)
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## BraTS2015
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [BraTS2015](http://www.braintumorsegmentation.org/) | | | | | | |
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/26367)
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# 脑
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## Iseg2019
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [Iseg2019](http://iseg2019.web.unc.edu/) | | | | | | |
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## ABIDE
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [ABIDE](http://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/abide/) | 是否有自闭症 | 分类 | MRI | 539+573 | | |
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自闭症患者的头部MRI扫描,包含539例自闭症患者和573个正常扫描对照组。 介绍论文: [The autism brain imaging data exchange: towards a large-scale evaluation of the intrinsic brain architecture in autism.](https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23774715)
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[下载地址](http://preprocessed-connectomes-project.org/abide/download.html)
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## ADNI
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [ADNI](http://adni.loni.usc.edu/data-samples/access-data/) | | | | | | |
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介绍论文: [Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI)](https://n.neurology.org/content/74/3/201.short)
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## 脑出血
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### RSNA Intracranial Hemorrhage Detection
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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| - | - | - | - | - | - | - |
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| [RSNA Intracranial Hemorrhage Detection](https://www.kaggle.com/c/rsna-intracranial-hemorrhage-detection) | | | CT | | | |
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/35741)
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# 肾脏
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||||
## Kits19
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[//]: # (TODO: 写简介)
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[Aistudio下载](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/24582)
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||||
# 肠
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||||
@@ -456,7 +895,7 @@ Aistudio下载 [Part1](https://aistudio.baidu.com/aistudio/datasetdetail/63957)
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| 名称 | 标注内容 | 类型 | 模态 | 数量 | 标签格式 | 文件格式 |
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||||
| - | - | - | - | - | - | - |
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| [MMWHS]() | 心脏 | 分割 | CT / MRI | 20CT、20MRI | 类别 | nii |
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| [MMWHS](https://zmiclab.github.io/projects/mmwhs/) | 心脏 | 分割 | CT / MRI | 20CT、20MRI | 类别 | nii |
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||||
mmwhs是心脏分割数据集,共有8类,MRI和CT两种模态 相关项目: [Hybrid Loss Guided Convolutional Networks for Whole Heart Parsing](https://github.com/xy0806/miccai17-mmwhs-hybrid)
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||||
@@ -654,16 +1093,56 @@ FIRE 是一个视网膜眼底图像数据集,包含 129张 眼底视网膜图
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||||
[胸部\肺部ct数据集](https://aistudio.baidu.com/aistudio/projectdetail/431782)
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||||
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||||
[//]: # (TODO: )
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||||
[adalca](https://github.com/adalca/medical-datasets)
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||||
[//]: # (TODO: )
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||||
[beamandrew](https://github.com/beamandrew/medical-data)
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||||
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||||
[//]: # (TODO: )
|
||||
[Stanford ML Group](https://stanfordmlgroup.github.io/)
|
||||
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||||
[//]: # (TODO: )
|
||||
[omic tools](https://omictools.com/)
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||||
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||||
[//]: # (TODO: )
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||||
[各领域公开数据集](https://zhuanlan.zhihu.com/p/25138563)
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||||
[//]: # (TODO: )
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||||
[medical-imaging-datasets](https://github.com/sfikas/medical-imaging-datasets)
|
||||
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||||
[//]: # (TODO: )
|
||||
[Open-Access Medical Image Repositories](http://www.aylward.org/notes/open-access-medical-image-repositories)
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||||
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||||
[//]: # (TODO: )
|
||||
[Medical Image Datasets Download Links](https://www.ilovephd.com/medical-image-datasets-download-links/)
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||||
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||||
[//]: # (TODO: )
|
||||
[HAM10000 dataset](https://dataverse.harvard.edu/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.7910/DVN/DBW86T)
|
||||
|
||||
[//]: # (TODO: )
|
||||
[Dermatology Image Classification](https://www.kaggle.com/yuningalexliu/dermatology-image-classification)
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||||
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||||
[//]: # (TODO: )
|
||||
[havard](https://library.med.utah.edu/kw/derm/)
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||||
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||||
[//]: # (TODO: )
|
||||
[usc](http://sipi.usc.edu/database/)
|
||||
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||||
[//]: # (TODO: )
|
||||
[burkely](https://www2.eecs.berkeley.edu/Research/Projects/CS/vision/bsds/)
|
||||
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||||
[//]: # (TODO: )
|
||||
[isdis](https://isdis.net/)
|
||||
|
||||
[//]: # (TODO: )
|
||||
[radiopedia](https://radiopaedia.org/articles/imaging-data-sets-artificial-intelligence)
|
||||
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||||
[//]: # (TODO: )
|
||||
[aimi](https://aimi.stanford.edu/research/public-datasets)
|
||||
|
||||
[//]: # (TODO: https://zhuanlan.zhihu.com/p/24634505 )
|
||||
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||||
# 贡献者
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||||
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||||
(按照首次贡献时间排序)
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||||
@@ -690,3 +1169,6 @@ FIRE 是一个视网膜眼底图像数据集,包含 129张 眼底视网膜图
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||||
2020/5/20<br>项目添加数据集计数和release note,数据集方面添加 RSNA骨龄,PathVQA,FIRE视网膜,DDSM乳腺癌等数据集
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||||
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||||
2020/5/13<br>项目在Aistudio公开,包含约40个数据集
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||||
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||||
[//]: # (TODO: 做一个tcia转nii的py程序)
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[//]: # (TODO: 图片一样的大小,居中)
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在新工单中引用
屏蔽一个用户